通过查询相关资料显示，北京市政府在通州地铁6号线郝家府站。因为北京市政府将搬至通州，北京市政府和委办局办公楼位于位于地铁6号线郝家府站附近的运河东大街北侧，市委和市人大、政协位于路南。具体消息可关注官方网站，获得第一手权威信息。