自2000年起，倪巧林投身于青虾工厂化育苗的探索。他不断学习，从野生亲本中汲取经验，将传统土池育苗革新为水泥池的工业化方式。他独创了交配池、抱卵虾池、育苗池和培育池四阶段管理法，这一创新极大地提升了交配、抱卵及成活率。令人瞩目的是，他实现了每立方米水体平均育苗量高达2.4万尾，推动了青虾优良品种的广泛种植，覆盖面积达到3000亩。

2003年，倪巧林又开始试验不同水产品的混养模式，将翘嘴红鲌（白水鱼）和匙吻鲟这两种珍贵鱼类成功混养。他突破了饲料供应的难题，引入人工配合饲料，这一创新在全市范围内首次实现。混养模式的推广面积达到了600余亩，每亩的净收入超过5000元，显示出显著的经济效益。

通过不懈努力，倪巧林创立的岑湖公司发展成为一个涵盖水产养殖、繁殖、仓储、加工和销售的多元化股份制企业。公司与350多户水产养殖户建立了紧密的合作关系，为他们提供苗种、饲料和销售支持。2003年，公司销售额达到了5280万元，利税超过150万元，上市水产品超过500吨。这些成就使公司连续三年荣获“青浦区十佳龙头企业”和“青浦区种养大户”等荣誉。

倪巧林本人作为企业领导者，集水产育苗、养殖、销售、科研和推广于一身，他以其创新精神和实践能力，引领当地农业科技创新，对青浦地区水产养殖业的发展起到了积极的推动作用。