关于大众新桑塔纳是否允许安装天窗的问题，我们需要明确一些关键点：

首先，车顶内部结构密布加强梁，任何对顶棚的切割都会对车辆的承重系统构成威胁。切割安装天窗可能会破坏原有的受力平衡，这绝非轻易之举。

其次，关于漏水问题，即使是原装天窗，也并非完美无缺。尽管原装设计中有一个积水的凹槽，能将漏出的水分导向A柱，但私自改造可能引入新的漏水风险，处理不当将给车辆带来严重隐患。

私自在车辆上改装天窗，对驾驶员和乘客来说，无疑增加了安全隐患。因为车辆在出厂前已经经过严格的试驾和碰撞测试，确保在出厂时已符合国家质量技术监督部门的安全标准。新交通安全法实施后，明确规定禁止私自改动车辆结构，包括天窗。在北京等地区，私装天窗甚至可能直接导致车辆无法通过年检。

综上所述，我们强烈建议，对于大众新桑塔纳，不要轻易考虑加装天窗。如果硬要改造，可能会严重损害车辆的安全性能，甚至导致验车无法通过。因此，在做出决定前，车主务必谨慎权衡。