近年来，虽然国产种研发能力逐步增强，市场占有率也稳步提升，然而在部分品种尤其是蔬菜品种上，国产种和“洋种子”依然存在一定差距。

江西省赣州市信丰县农伯乐蔬菜专业合作社理事长赖焕华表示，他也尝试过一些国产种子，但种出来的蔬菜在产量、质量和品相上和进口的还是有差距，“一些国产种子在大田里种可以，但到大棚里就不行了”。

在业内人士看来，一些国产种子不敌“洋种子”，主要原因还在于国内种业研发机构和企业规模较小，研发投入不足。一位曾在国外种子企业工作过的科研人员谈到，国外种业巨头已形成分工协同的完整研发体系，形成了专业化的“流水线研发”，而国内种子研发多数还停留在“工匠时代”，仅依靠少数育种家，且研发各环节割裂，“部分育种项目就是为了完成任务，与市场脱节，具有推广价值的突破性品种少。”