亳州窦庄拆迁商铺的补偿是根据《中华人民共和国城市房屋拆迁条例》和相关政策规定执行的，补偿内容一般包括房屋补偿、过渡补助和安置补助等方面。

首先是房屋补偿，根据房屋的性质及其所在的市场价格，可以通过按揭或者转让的方式进行补偿。如果商铺是属于自住，可以获得等值的官方评估价格并支付现金；如果是自己投资建设的商铺，补偿的形式可能更多样化，可以通过购买新房或者拆迁安置房等形式进行补偿。

其次是过渡补助，因为拆迁过程中商铺经营可能会受到一定的影响，因此可以获得一定期限的租金补贴或者过渡期经营补偿金。这是为了帮助商户在拆迁后有一个过渡期，确保其生产经营能够顺利进行。

最后是安置补助，如果商铺拆迁后需要重新安置，政府会提供相应的补助，例如提供一定的面积和质量的拆迁安置房，或者提供一定的购房补贴。这样可以满足商户的经营需求和生活需求。

需要注意的是，商铺拆迁补偿的具体方案还需要根据当地政策进行调整，并且可能会因不同的情况存在一些具体的细则和限制。因此，在窦庄拆迁商铺补偿方面，建议与相关政府部门联系，了解详细政策，确保自己的合法权益得到保障。