1.留种。收获前半个月，在田间选择生长健壮、穗多而密、无病虫害的单株或田块留作采种母株。当种子充分成熟、籽粒饱满、呈棕褐色时采集种子。采集时，将荆芥割回，摊放于晒场上晒干，拍打出种子，清除茎叶杂质，装入布袋，悬挂于通风干燥处贮存备用。

2.采收。春播的荆芥于当年8～9月收获；秋播的于第二年5月下旬至6月上旬收获；夏播的当年10月收获。当穗上部分种子变成褐色，顶端的花尚未落尽时，于晴天用镰刀从基部割下全株。

3.加工。将采收的荆芥运回，摊于晒场上，切勿长久暴晒，因荆芥含有挥发油，在高温下易散失影响质量，晒至七八成干时，收集于通风处，茎基着地，相互搭架，继续阴干即可。若遇阴雨天气，可用无烟火烘干，温度不宜太高。一般每667米2产干货200～300千克，产品以身干、色淡黄绿、穗长而密、香气浓郁者为佳。