浸种催芽是西瓜种子萌发的必要步骤，其目的是促进种子快速吸收水分，缩短发芽时间。浸种时间受水温、种子大小和种皮厚度的影响。在常温下，通常浸种6到8小时即可；温汤浸种则需要2到4小时；使用25到30°C的恒温浸种，适宜时间为2小时。过长的浸种时间或过高的水温会导致储藏的营养损失，影响种子发芽。浸种后需反复揉搓种子，用清水洗净表面的胶状物质，以利于萌发。

催芽是确保种子在充分吸收水分后，在适宜的环境中快速萌发的过程。浸种后，用湿沙、锅木屑与种子混合，或者用湿布、毛巾、草包包裹种子，置于28到30°C的条件下催芽。大约1到2天后，70%以上的种子的胚根长至0.3到0.4厘米时即可播种。为避免胚根过长，可将符合标准的种子分次取出，混入适量的河沙，放置于室温下，控制胚根的生长。尚未发芽的种子继续催芽，待多数种子发芽后再一次性播种。若催芽期间遇到寒流天气，也可以采用此法保存，待天气好转后播种。