彩色防水防霉填缝剂在使用过程中需注意其粉、水比例，这一比例会因砖缝宽度及环境干燥程度的不同而有所调整。缝隙较窄的砖缝可适当调稀，砖缝宽度应在1.5～5㎜之间。若使用粗砂填缝剂，则砖缝宽度应控制在2～13㎜。

使用时应避免使用酸性清洁剂对已填缝的瓷砖进行清洁。同时，施工时的环境温度应在5～40℃之间，且不能在下雨的环境下进行施工。在伸缩缝处，应选用中性胶等专用填缝剂以确保其稳定性与适应性。

施工过程中，要尽量避免填缝剂过厚地残留于砖面，以减少后续清洁的难度。在施工完成后的24小时内，避免在填缝的瓷砖及填缝剂上施加任何压力、刮划或让其暴露于雨水之下。

对于黑色填缝剂的施工，需在完成后的10分钟内使用干布清理基面，以避免填缝剂发白。待其完全干固（约24小时）后，可以使用清水对残留斑迹进行彻底清洁。

在进行大面积施工时，应考虑预留适当的伸缩缝，以适应砖块的热胀冷缩。施工后5～6小时进行一次初步的养护，24小时后进行第二次养护，确保填缝剂的牢固与稳定性。