资兴市水利局下属机构主要包括水土保持预防监督站、水利水电勘测设计室、农村水电及电气化发展中心、水利工程管理站（质监站）、防汛办、水建办等。

水土保持预防监督站主要负责全市水土保持预防监督工作，包括贯彻落实水土保持法律、法规和方针政策，编制水土流失防治规划、方案并组织实施，审批全市水土保持开发建设项目方案，提出水土流失重点预防保护区、重点监督区和重点治理区的具体范围，征管全市境内水土保持补偿费和水土保持流失防治费，保护和管理水土保持设施，查处水土保持违法案件，做好水土流失综合治理工作。

水利水电勘测设计室负责全市水利水电工程规划、勘测、设计，协助其它职能部门统一规划编制全市水利水电发展规划等工作。

农村水电及电气化发展中心组织指导水利行业的水电建设与规范化管理，组织编制全市农村水电及电气化发展规划，小水电代燃料生态工程规划，参与制定地方电网建设发展规划，制定全市农村小水电技术更新改造计划和电力生产年度计划，并组织协调实施。负责全市水电行业的业务指导、从业人员技术培训，积极开展水利经济业务的指导和技术服务，做好小水电发电、水利经济报表统计等工作。

水利工程管理站（质监站）负责全市水利工程建设、管理和质监工作，规范和完善全市水利工程设施的建后管理工作。做好全市农村饮水安全工程规划、建设和管理工作，做好全市小型农田水利工程规划、建设和管理工作。全面掌握全市水利工程建设动态，为领导决策提供科学依据。做好水利建设、水利综合报表上报、材料汇报工作。

防汛办、水建办负责防汛抗旱指挥部日常工作，指导乡镇防汛抗旱工作，督促落实防汛抗灾责任制。组织执行上级防办和市防汛抗旱指挥部的指示、调度命令，协调市防汛抗旱指挥部成员单位的工作。负责组织全市防汛安全检查，督促处理险工隐患，落实防汛物质、器材储备和管理。参与全市防洪规划编制工作，组织制定主要流域、水库等山洪灾害防御预案。履行防汛抗旱工作职能，制订度汛计划和抓好水库防汛抗旱调度，严密组织防汛值班和日常事务性工作，抓好山洪地质灾害防御和防汛抢险救灾工作，及时抓好“三情”的收集和反馈，抓好防汛抗旱报表统计工作。同时，抓好“东江杯”、“郴江杯”、“芙蓉杯”水利建设竞赛活动的筹备和实施工作。