计算土地增值税时扣除土地价款。

详细解释如下：

一、土地增值税与土地价款

土地增值税是对于土地使用权转让及其地上建筑物等增值部分所征收的税费。在土地增值税的计算过程中，土地价款是一个重要的扣除项。土地价款通常指的是购买土地使用权所支付的费用，包括土地出让金、拆迁补偿费等相关费用。

二、扣除土地价款的含义

在土地增值税的征收过程中，扣除土地价款意味着在计算土地及其附着物的增值部分时，需要将购买土地使用权所支付的费用予以扣除。这样做的目的是真实地反映土地及其附着物的增值部分，避免重复征税，鼓励土地的合理流动和高效利用。

三、具体的扣除规定

在实际操作中，扣除土地价款的具体规定可能因地区和政策差异而有所不同。一般来说，需要提供相关的土地使用权交易凭证和支付凭证作为扣除的依据。此外，还需要根据当地的税务政策和规定进行操作，以确保符合税收法规的要求。

总结来说，土地增值税中的扣除土地价款是指在计算土地增值税时，将购买土地使用权所支付的费用予以扣除。这一规定旨在真实反映土地的增值部分，鼓励土地的合理流动和高效利用。在具体操作中，需要遵循当地的税务政策和规定，确保合规操作。