加热棒放在底滤缸不会影响水泵。

因为底滤鱼缸内的加热棒一般都是放在潜水泵那一格的水箱中。因为这样进入鱼缸的水较容易均温，放在鱼缸内比较会有温度差。底滤鱼缸加热棒摆放即其他问题：

1、鱼缸加热棒在空气中切勿通电。因为其在空气中升温极速，轻则烧坏加热棒，重则炸碎玻璃或烧伤手。即使断电后也不能立刻从水中拿出来，这时候的温度也是非常高的，同样容易烫伤人和烧坏加热棒。

2、教育小孩不要触碰鱼缸加热棒。

3、换水时注意不要使水位过低露出加热棒。

4、注意鱼缸加热棒的寿命：建议双金属片加热棒。

选择加热棒技巧：

必须考虑功率匹配的问题，一般地说，每5升水需10W的功率。例如，90厘米长、30厘米宽、38厘米深的水族箱，容积为100升，应选用200W的加热棒。对较大的，90或以上的水族缸，需要使用两支100W加热棒，并分置于水族箱的两端，这样受热均匀，效果更好。

更好的使用加热棒一定要考虑鱼缸所处的环境，极端冷是不需要变频的，极端热是不需要加热棒的。能够稳定恒温就是最节能的加热棒，而热敏电阻受制于热敏材料的质地，达不到理想程度，所以就此推导出一个结论，能够根据温度变化自动调整功率的加热棒才是最节能的加热棒。

以上内容参考：百度百科--加热棒