骨骼肌、视网膜和肾小球的毛细血管基底膜，在电子显微镜下主要是呈现为不定形态的微细纤维的外套，集中于毛细血管内皮的管腔面，延伸于包绕其中的外膜细胞，在肾小球、视网膜以及骨骼肌中的毛细血管基底膜是由致密板组成。

毛细血管基底膜有数种不同的功能，各个基底膜的功能除与血管壁的稳定性及物理特性有关外，基底膜还能为内皮细胞的附着提供支架，有助于内皮细胞与该处的再生，并且在损伤后重建血管。

由此可见，毛细血管的基底膜可作为一个粗糙的滤器，将脂蛋白等小血浆颗粒筛出，并且可以在丧失正常的内皮屏障后，促进微小血浆颗粒脂蛋白和已凝聚的蛋白滤出，对于基底膜其他的特性目前仍有很多不明确的。