答案：马桶变黄的主要原因是长期的使用与清洁不当。

详细解释：

一、马桶材质老化

马桶长时间使用，其表面材质可能因为频繁接触水和清洁剂而老化，导致颜色发生变化。特别是在一些经常接触水的地方，如马桶内壁和底座，更容易因水渍残留和清洁剂残留物的累积而变黄。

二、清洁不彻底或不正确

若日常清洁工作不到位，如未定期清理马桶表面的水渍、污渍或残留物，这些物质会长期附着在马桶表面，导致颜色逐渐变黄。此外，使用不合适的清洁剂或清洁方法也可能加剧马桶变黄。

三、水质影响

部分地区的水质偏硬，含有大量矿物质。这些矿物质在长期使用过程中可能会在马桶表面形成水垢，造成颜色发黄。尤其是在卫生间环境较为潮湿的情况下，水垢的形成和积累会更加明显。

四、长时间未更换配件或密封件老化

马桶的一些配件如密封圈等长时间未更换，可能会因老化而与马桶主体产生颜色上的差异，甚至导致整体外观发黄。此外，一些密封件老化后可能释放某些化学物质，这些物质与水和清洁剂发生反应，进一步影响马桶的颜色。

为了保持马桶的清洁和延长使用寿命，建议定期进行深度清洁，使用合适的清洁剂和工具，并注意保持卫生间通风干燥。同时，根据使用情况定期检查并更换老化配件。