位置区别，功能区别。

1、位置区别：樟木头站位于樟木头镇中心，离樟木头镇政府、商业区和居民区较近。而樟木头东站位于樟木头镇的东部地区，距离樟木头镇中心较远，更靠近其他地区和乡镇。

2、功能区别：樟木头站是一个主要的铁路客运站，提供城际列车和长途列车的服务。乘客可以乘坐列车前往其他城市和地区。而樟木头东站是一个辅助的铁路车站，主要用于承接地方交通服务，如城际轨道交通、地方列车等。