苹果SE的屏幕尺寸为4英寸，分辨率为1136x640像素，像素密度为326ppi，屏幕类型为Retina显示屏。

处理器采用苹果A9芯片，64位双核心，主频为1.84GHz，内置M9协处理器，比上一代iPhone 5S性能提升了70%。

内存容量分为两种：16GB和64GB，不支持扩展存储。

前置摄像头为120万像素，支持Retina闪光灯、自动HDR照片、面部识别功能。后置摄像头为1200万像素，支持Live Photos、自动HDR照片、闪光灯等，录制视频最高可达4K分辨率。

支持双频Wi-Fi（802.11a/b/g/n/ac）、蓝牙4.2、NFC、GPS、GLONASS等功能，支持指纹识别技术。

电池容量为1624mAh，支持快速充电和无线充电，待机时间最长可达10天，通话时间为14小时。

苹果SE采用iOS 9.3操作系统，支持Siri语音助手、iCloud云服务、Apple Pay移动支付等功能。

机身尺寸为123.8×58.6×7.6mm，重量为113克，有四种颜色可选：银色、金色、深空灰色、玫瑰金色。

总的来说，苹果SE虽然外观与iPhone 5S类似，但在硬件配置上有较大程度的提升，同时保持了较为合理的价格，是一款性价比较高的iPhone手机。