三层别墅装修费用的确定主要依赖于预算的设定。通常，装修费用占别墅总费用的百分之十五左右。具体构成比例为：卫生间、厨房、客厅、卧室分别为9:7:4。以二线城市为例，装修档次较低时，价格大约在100-500元/平米之间；中档装修价格则为1500-2000元/平米；高档装修价格达到2000元/平米。若装修档次稍高一些，费用可能会占到建筑费用的1/4左右。

对于普通装修，以400平米的面积计算，别墅装修总费用大约在15-20万元之间。如果追求欧式中高档装修，价格可能会上浮10%左右。别墅装修材料与普通装修相似，包括墙面材料、地面材料、板材、洁具和厨具等。选择时，建议先进行市场考察，了解品牌产品与非品牌产品的费用差异，然后根据实际情况合理选择装修材料。

别墅装修的主要费用包括设计费、轻工辅料、主材以及后期配饰。设计费根据需求不同，每平米几十元到几百元不等；轻工辅料与主材每平米的费用范围为600-1500元；后期配饰的费用则难以具体估算。在费用上，装修别墅要注重主次分明，不同房间可选择不同档次的装修，从而节省成本。

总的来说，装修三层别墅的具体费用取决于多种因素，包括装修档次、材料选择以及个人需求等。建议在开始装修前，详细规划预算，并进行充分的市场调研，以便做出明智的选择。