1. 节水效果差异：虹吸式马桶因设计结构需存留更多水以隔绝异味，用水量相对较多。而直冲式马桶利用水的重力冲走废物，每次用水量较少，更为节水。

2. 冲水声音差异：虹吸式马桶采用吸入式排污，水流冲击声音较小，因而被称作静音马桶。直冲式马桶因使用大量水流瞬间冲走废物，声音相对较大。

3. 冲水效果差异：虹吸式马桶的管道细长，冲水时水面较高，废物随水一同排出，水封较高，有效防止反味。直冲式马桶管道简洁、短捷、粗壮，依靠水的重力加速度冲洗干净，不易堵塞，但可能产生异味。