伯利兹黄檀的木材呈现出半环孔材的特点。其心材呈现出独特的浅红褐色，特征显著，呈现出深浅相间的条纹图案。边缘部分，边材的颜色相对较为清淡，与心材形成鲜明对比。

在生长过程中，生长轮的痕迹清晰可见，这是其木材结构的一个重要指标。在微观观察下，管孔在放大镜下显得非常明显，它们分散分布，数量适中但并不密集，大小各异，部分管孔内还含有树胶，增添了其独特的质地。

此外，伯利兹黄檀的轴向薄壁组织丰富多样，包括环管状、翼状、带状以及轮界状等多种形态，这些都为木材的美观性和复杂性增添了额外的魅力。在木射线方面，放大镜下观察到它们较为密集，但宽度却相当狭窄。波痕的存在也略显清晰，增加了木材的自然纹理。

然而，在胞间道方面，伯利兹黄檀的表现并不明显，这可能影响了其某些特定的物理性质，但整体上，这些微观特征共同塑造了伯利兹黄檀独特的木材微观结构。