杭州市住房公积金和浙江省住房公积金的区别如下：

一、两者的主管部门不同

杭州市住房公积金归属杭州市住房公积金中心管理，浙江省住房公积金归属浙江省住房公积金中心管理。

二、两者服务对象的所属单位性质不同

浙江省住房公积金，是指浙江省内达到省管级别的机关或企事业单位住房公积金的缴存、提取、使用及相关的管理、监督活动。

而杭州市住房公积金，主要是杭州市内达到市一级别的机关或企事业单位住房公积金的缴存、提取、使用及相关的管理、监督活动。

三、两者的使用区域不同

杭州市公积金只能在所在市级城市使用，浙江省公积金可以在省行政区域内使用。

四、两者的还贷方式不同

杭州市公积金需按定的比例同时还贷，可能年限会比较长。浙江省公积金可以先还商业贷款的部分，再还公积金贷款的部分。

参考资料来源：百度百科-住房公积金

参考资料来源：杭州住房公积金管理中心—公积金贷款