宁波市住房公积金管理中心余姚分中心的主要职能包括：

首先，它负责执行和实施国家、省级以及宁波市关于住房公积金管理的相关法律、法规和政策，确保政策的有效落实，并积极响应市住房委员会的决策和决定。

其次，中心承担着重要的行政执法职责，对全市住房公积金的缴存、支取、个人住房贷款发放及偿还等行为进行严格的监督和检查，对任何违反规定的活动进行依法处罚。

此外，中心还负责编制全市住房公积金、住房资金以及物业管理资金的归集、使用计划和执行情况报告。年度预算、决算报告和增值收益分配方案的编制也是其职责之一，同时对这些执行情况实施检查，确保资金的合理运用。

在财务方面，中心负责职工住房公积金的业务记录，包括缴存、提取、使用、转移和封存等，审批并核准公积金的提取和使用申请。

资金安全和增值是中心的重要任务，他们负责公积金的财务核算，并公开经过审计部门审计的财务报告，以保证资金的透明度和公信力。

同时，中心还负责发放住房公积金个人住房贷款，建立个人信用系统，确保贷款的按月回收。

另外，对于职工一次性住房补贴和公积金补贴，中心也负责记录缴存、提取和使用情况，并审批相应的提取和使用申请。

最后，中心还会根据市政府和上级业务主管部门的要求，处理其他相关事项，确保各项工作的全面展开。