房屋二套房契税的计算方式主要取决于房屋面积。一般来说，如果购买的是住宅类第二套房，且房屋面积不超过140平方米，契税可以按成交价的1%缴纳；若面积超过140平方米，则契税需按成交价的2%缴纳。然而，也有地区规定，不论面积大小，第二套住宅类房屋均按成交价的3%缴纳契税。

此外，如果购买的是商业用房，契税则统一按成交价的3%缴纳，不区分首套和二套。契税的具体计算方式为购房成交总价格或市场指导价乘以相应税率。值得注意的是，如果成交价无正当理由地低于市场价格，征收机关可能会参照市场价来评定。

在缴纳契税时，建议咨询当地税务部门或专业机构，以获取最准确、最权威的信息。