不动产证与房屋所有权证的不同之处包括：

1. 不动产证由国土资源部监制的不动产登记簿证构成，涵盖了房屋所有权证和土地使用权证。而房屋所有权证则是由房管部门发放的，用以证明房屋所有权归属的书面凭证。

2. 不动产证具备证书编号和不动产权编号，并且含有防辐射标签。相比之下，房屋所有权证只有房屋所有权证号，并无防辐射标签。

3. 随着不动产登记制度的改革，房屋所有权证已经与土地使用权证合并为不动产权证书。

不动产证的历史沿革涉及以下几个方面：

1. 不动产统一登记制度的引入：2015年《不动产登记暂行条例》实施，标志着不动产统一登记制度的开始。

2. 房屋所有权证的替代：随后，不动产权证书逐步替代了原有的房屋所有权证和土地使用权证，实现了多证合一。

3. 信息化管理的推进：不动产登记信息系统的建立，实现了不动产登记数据的电子化和网络化管理。

4. 提高交易安全性：通过使用统一的不动产证，交易的安全性得到提升，减少了因证件不统一引发的法律纠纷。

5. 促进市场统一：不动产统一登记制度有助于形成统一的房地产市场，提高了市场的透明度和效率。

综上所述，不动产证和房屋所有权证在发放部门、证书内容以及合并情况上存在差异。

【法律依据】

《不动产登记暂行条例》第四条：国家实行不动产统一登记制度。不动产登记遵循严格管理、稳定连续、方便群众的原则。不动产权利人已经依法享有的不动产权利，不因登记机构和登记程序的改变而受到影响。

《中华人民共和国土地管理法》第十二条：土地的所有权和使用权的登记，依照有关不动产登记的法律、行政法规执行。依法登记的土地的所有权和使用权受法律保护，任何单位和个人不得侵犯。

《中华人民共和国城市房地产管理法》第六十条：国家实行土地使用权和房屋所有权登记发证制度。