上合组织总部位于中国，具体设立在北京市。这是迄今为止唯一一个在中国境内成立、以中国城市命名，并且总部设在中国境内的区域性国际组织。上合组织有两个常设机构，分别是设在北京的秘书处和设在乌兹别克斯坦首都塔什干的地区反恐怖机构执行委员会。上海合作组织（英文名：Shanghai Cooperation Organization，俄文名：Шанхайскаяорганизациясотрудничества），简称上合组织（SCO、ШОС），成立于2001年6月15日，创始成员包括中华人民共和国、哈萨克斯坦共和国、吉尔吉斯共和国。