马桶冲水时底座漏水可能是由于法兰接口密封不严、马桶质量问题或安装不当导致的。

一、法兰接口密封不严是常见原因。

马桶的底部与地面之间通过法兰接口连接，如果这一接口的密封工作没有做好，就很容易导致漏水。这种情况可能是因为选用的法兰接口密封材料质量不佳，或者安装时未密封严实。长时间使用后，由于老化或磨损，密封性能逐渐下降，冲水时就会出现底座漏水的问题。

二、马桶质量问题也可能引发漏水。

如果马桶本身存在质量问题，如陶瓷烧制不严密或者内部管道与零件的质量不合格，都有可能导致使用过程中出现漏水现象。这种情况下，冲水时压力的改变可能会使质量不佳的马桶部件出现渗漏。

三、安装不当同样会导致底座漏水。

马桶的安装过程需要确保各项部件的精确对接和固定。如果安装时未能正确放置法兰接口或者固定螺丝未拧紧，都有可能使马桶在使用中出现晃动或位移，从而导致密封失效，出现漏水情况。

为了确保马桶的正常使用并避免漏水问题，建议在选购马桶时注重其质量及品牌信誉，同时在安装过程中严格遵循安装规范，确保每个细节的安装质量。若遇到冲水时底座漏水的问题，建议及时联系专业人员进行检修或更换相关部件。