对于层高3米6的房屋，设计三跑楼梯时，最佳尺寸需综合考虑楼梯的进深、宽度、每跑的尺寸以及转台尺寸，以确保楼梯既实用又安全。

楼梯间的宽度建议至少为306cm，这样可以确保有足够的空间供人们上下楼梯，避免拥挤。水平进深建议为387cm，以确保楼梯的每一跑都有足够的长度，使人们在上下楼梯时感到舒适。

每跑的尺寸建议为26cm（高度）x10/14.4cm（宽度）x11（踏步数），跑宽为127cm。这样的尺寸设计既符合人体工学，又能保证楼梯的稳固性。转台尺寸也建议为127cmx127cm，高程分别为158.4cm和201.6cm，以便于人们在楼梯间转换方向。

此外，楼梯的宽度不应小于1.1m，尤其是有栏杆的情况下，以确保安全。每个台阶的宽度和高度应分别不小于0.26m和0.175m，这样的尺寸设计既实用又符合安全标准。

综上所述，对于层高3米6的房屋，设计三跑楼梯时，最佳尺寸建议为楼梯间宽度至少306cm，水平进深387cm，每跑尺寸为26cmx10/14.4cmx11（跑宽127cm），转台尺寸为127cmx127cm，并注意楼梯宽度、台阶尺寸以及坡度的设计。这样的尺寸设计既实用又安全，能够满足大多数家庭的需求。