维修基金的使用程序，需分两阶段进行。

在维修资金未由业主大会管理前，物业服务企业需根据维修和更新、改造项目情况提出使用建议，无物业服务的住宅由相关业主提出建议。建议通过后，由物业服务企业或相关业主组织实施，随后向政府建设主管部门申请列支。建设主管部门审核同意后，银行将维修基金划转至维修单位。

之后，维修资金转由业主大会管理后，流程稍有不同。物业服务企业提出详细维修基金使用方案，包括项目、费用预算等，经业主大会通过后执行。物业服务企业向业主委员会提出列支申请，业主委员会审核同意并报建设主管部门备案。如果发现申请不符合规定，主管部门会要求改正。最后，业主委员会向银行发出划转通知，银行将维修基金划转至维修单位。

需注意，维修基金是由业主共同筹集，所有权归业主，使用权则归全体业主，单个业主不能提取自己的份额。维修基金与具体房屋相连，随房屋存在而存在、灭失而灭失，不因业主变更而改变。当房屋产权变更时，维修基金也应更名至新业主名下。