纯净水虽然纯净，但其缺乏对人体有益的矿物质和微量元素，长期饮用可能会导致营养失衡。健康饮水应含有一定量的矿物质，而纯净水在净化过程中会去除掉镁、锌、铁、碘等元素。人体所需的十多种微量元素主要来源于饮用水，因此长期饮用纯净水的人即使调整食物结构，也难以完全弥补这些元素的缺乏。

桶装纯净水一旦启封，24小时后就开始滋生细菌，若保管不当，细菌会迅速繁殖，使水变质。因此，饮用纯净水的时间不宜过长，夏季48小时以内、冬季一周内饮用较为安全。桶装纯净水还存在二次污染的风险，有的不良商家生产的桶装水不仅不干净，甚至可能引起细胞代谢减慢和提前衰老。

纯净水的分子结构在过滤过程中可能被改变，导致其吸收效果下降，这也是为什么有时喝纯净水无法解渴的原因。桶装纯净水的风险更大，不仅会导致微量元素和钙、镁等元素缺乏，还可能引起儿童生长发育迟缓、智力低下，成年人则可能患上动脉硬化、心脑血管病、糖尿病和高血压等疾病。

由于纯净水是呈弱酸性的，长期饮用会导致体内环境破坏，降低免疫力。因此，尽管多喝水有益健康，但纯净水不宜作为长期饮用的水源，特别是对老年人、心血管病患者、孕妇和儿童等特殊人群来说，更不宜多喝。