区别在于实践方法和目的不同。

1、设施农业是一种在高度控制的室内或半室外条件下种植食物的农业形式，通常使用大量现代技术设备来优化植物的生长环境，如室内照明、温湿度控制、供应二氧化碳等，以及可编程控制的灌溉系统、肥料喷雾器等等。

2、高标准农田是一种在传统土地上实施技术升级和耕作改进的农业形式，目的是根据当地的土地特点和农作物的生长要求，利用现代高科技设备和种植管理技术，在一定的生产成本和资源消耗的基础上，提高农作物的产量、品质和利用效益。