大果紫檀和刺猬紫檀可从以下方面辨别。从颜色上看，大果紫檀的心材颜色偏红，常带有深色条纹；刺猬紫檀颜色较深，多为黄褐色或深黄褐色，常带黑色条纹。在纹理方面，大果紫檀纹理细腻，有虎皮纹等美观纹理；刺猬紫檀纹理相对粗犷，纹理交错。气味也有差别，大果紫檀有淡淡的檀香味，而刺猬紫檀有特殊的酸臭味，不过新砍伐时不明显，在不通风环境下放置一段时间后较容易闻到。从密度上讲，大果紫檀的密度相对刺猬紫檀略大一些，但这需要一定的经验和专业工具来准确判断。