用途、结构和容量、标记和识别等区别。

1、用途：冻存管主要用于样品的冷冻和冻存，可以在低温条件下保存生物样品，如细胞、DNA、RNA等。冻存管有较好的密封性和耐冻性能，适合长期保存。EP管（全称为Eppendorf管）是一种多功能试管，广泛用于配制试剂、混合溶液、离心等多种实验操作。

2、结构和容量：冻存管采用聚丙烯或聚乙烯材料制成，有圆底或锥形底部，容量在0.5mL至2mL之间。冻存管的底部通常较厚，有助于样品的冷冻和冻存。EP管采用聚丙烯材料制成，有圆底，容量在0.5mL至2mL之间。

3、标记和识别：冻存管有刻度线和标签区，可以方便标记样品的信息，如样品编号、日期等。冻存管使用标签或贴纸进行标识。EP管有刻度线和透明外壳，可以方便观察样品的体积和状态，无需额外标识。