阜阳市住房公积金管理中心的历史可以追溯到1992年，当时经原地区编委批准设立了阜阳地区住房资金管理中心，隶属于地区房改办。这一阶段，中心主要由办公室、归集科、信贷科、财务科等四个职能科室构成，分别在太和县、阜南县和颍上县设立了三个公积金业务经办网点。

随着2002年国务院对住房公积金管理机构进行重大调整，阜阳市公积金中心与房产局（房改办）分离，获得了独立的管理地位。同年11月27日，经省机构编制委员办公室审核并批准，正式成立了阜阳市住房公积金管理中心，自此进入了新的发展阶段。

在阜阳市人民政府的领导下，公积金中心受市住房公积金管理委员会委托，严格执行《住房公积金管理条例》。其主要职责包括对全市住房公积金的统一决策、管理、制度制定和核算。具体任务涵盖了编制公积金的归集和使用计划，记录职工公积金的缴存、提取和使用情况，审批公积金提取和使用，确保公积金的保值增值，以及编制并报告公积金管理执行情况，同时还要执行市住房公积金管理委员会的各项决定。