直通网线和交叉网线在多个方面存在显著差异。

首先，从线序排列上看，直通网线，也称为标准线或正线，其两端都遵循相同的线序标准，通常是T568B标准，即线序为橙白、橙、绿白、蓝、蓝白、绿、棕白、棕。而交叉网线则在一端采用T568A标准（绿白、绿、橙白、蓝、蓝白、橙、棕白、棕），另一端采用T568B标准，形成交叉线序。

其次，两者在使用场景上有所不同。直通网线主要用于连接不同类型的设备，如电脑与交换机、路由器与交换机等。而交叉网线则主要用于连接相同类型的设备，如两台电脑之间或两个交换机之间的连接。

最后，从传输方式上看，直通网线直接传输信号，而交叉网线则通过交叉连接实现信号的传输。这种差异使得两者在特定的网络环境中具有不同的应用价值。

综上所述，直通网线和交叉网线在线序排列、使用场景和传输方式等方面均存在显著差异。在实际应用中，应根据具体的连接需求选择合适的网线类型。