娄底市住房公积金管理中心设有多个科室，以高效管理和服务住房公积金业务。综合科主要职责包括制定中长期规划，监督计划执行，进行统计分析，调查政策研究，起草法规制度并实施执法检查，负责人事、劳动工资和机关行政事务等工作，由邓斌辉科长领导。

计划财务科专责公积金的财务管理，会计核算，编制预算和决算，接受审计监督，并确保资金的保值增值，由周康生科长负责。归集提取科负责全市公积金的归集、对帐、政策宣传、额度调整以及公积金提取、封存等事务，由李雄俐科长管理。

信贷科则管理住房抵押贷款和组合贷款业务，与商业银行合作，由肖丽霞副科长协助科长进行贷款审批和管理。监察稽核科承担全系统的稽核审查，对业务部门进行审计监督，由肖洪辉科长领导。

法制科负责违反《住房公积金管理条例》的监督执法，政策法规研究，以及法律诉讼活动，阳国栋副科长在这一领域发挥重要作用。这些科室的设立旨在确保住房公积金的公平、透明运作，为市民提供可靠的服务和保障。