南宁住房公积金管理中心的机构设置根据《南宁住房公积金管理中心机构设置和人员编制的通知》（南编〔2003〕36号）和《关于南宁住房公积金管理中心机构编制有关问题的批复》（南编〔2007〕68号）进行。中心主要由以下部门构成：

办公室：负责中心的行政事务、人事劳资和后勤服务等综合性管理工作。

归集管理科：负责公积金和住房补贴的归集，业务拓展，以及信息化建设和管理。

信贷管理科：专门处理住房公积金个人住房贷款业务。

财务会计科：负责公积金和相关资金的会计核算，以及管理中心的财务管理工作。

法规稽核科：负责管理中心的法规事务，内部审计，以及综合报表和资金计划的编制工作。

铁路分中心：在南宁铁路局管辖范围内负责公积金的具体管理工作，下设综合科、归集管理科等。

此外，还有七个管理部，分别负责特定区域的公积金管理任务：

邕宁管理部：在邕宁和良庆区负责公积金的归集、管理等，位于红星路红星小区。

武鸣管理部：在武鸣县负责公积金管理，地址为湘山大道福源小区商住楼6-1号。

横县管理部：在横县州镇负责公积金管理，地址为柳明路203号。

宾阳管理部：在宾阳县卢圩镇农行大厦三楼处理公积金业务。

隆安管理部：位于隆安县金城大厦3楼，负责隆安区域的公积金管理。

马山管理部：在马山县中学街农行办公楼一楼，负责马山的公积金管理工作。

上林管理部：在上林县政府路工商局办公室二楼，处理上林县的公积金事务。

以上是中心的基本机构布局和地址信息。