微信商家版与个人版在使用上有显著差异。首先，商家版收款码适用于更广泛的商业场景，商家可以自主申请，审核通过后，统一的费率是0.6%，而通过微信支付服务商申请的商家版，费率可以进一步降低至0.3%到0.6%。商家版收款码不仅支持零钱、借记卡和信用卡支付，还无限制的支付额度，且支持退款和账单查询，可以生成多门店的收款码，便于分门店查看收款记录和经营报表。其资金收入会汇总到总账户，便于对账。

相比之下，个人收款码适用于个人或小型摊贩的日常收款。个人收款码即时到账，可以用于转账和提现，但提现时需收取0.1%的手续费。值得注意的是，个人收款码不支持信用卡付款，且全年收款限额为20万元。个人收款码功能较为简单，无经营报表功能，也不能进行附件发券等营销活动，适用于流动摊位或个人小便利店。

总结而言，如果只是进行简单的日常收款，个人收款码已足够满足需求。而如果业务规模扩大，需要更精细的管理和报表功能，商家版则更为合适。