小叶紫檀的修剪一般在每年的3-5月生长旺盛期修剪。

修剪时，需要先将枝干培养到合适的粗度，然后在第一根枝干上剪掉一小段，等到修剪过的纸条生长出第二枝节时再将其培育到合适的粗度，再依次剪掉一小段，以此类推。但需注意每节保留何等长度，保留多少小枝，都需根据盆景本身造型来定，要达到疏密有致。