划拨土地出让金计算方法如下：第一次交易时，按照土地评估价的1%收取。对于第二次或多次交易，如果无特殊政策，则需按照土地级别系数与建筑面积的乘积来收取划拨土地增值金。

根据《土地管理法》第五十六条，建设单位在使用国有土地时，应遵守土地使用权出让或划拨批准文件的规定。若确需改变土地用途，需获得自然资源主管部门的同意，并报原批准用地的人民政府批准。在城市规划区内改变土地用途，还需先征得城市规划行政主管部门的同意。

综上，划拨土地出让金的计算与收取，取决于土地的交易次数以及土地用途的变更情况。确保土地使用的合法性和合规性，是避免支付额外费用的关键。