细菌屋要泡在水里，而且需要水体流动起来。它本身是用来容纳硝化细菌的场所，这样可以起到生物过滤的功效，从而更好的进行生态循环。硝化细菌在鱼缸中是必不可少的，水中的残饵、粪便分解后，会产生对鱼儿有害的氨氮，而硝化细菌的作用就是将其转化为硝酸盐，维持了水质。