呼和浩特市住房保障和房屋管理局内设机构如下：

党委办公室: 负责机关党建工作，干部选拔任用及党群管理工作，包括党的基层组织管理和党员管理。

办公室: 负责制定规章制度，处理文电事务、会务接待，以及房产市场信息化建设等工作，协调政务公开和热线受理。

人事科: 负责人事编制工作，职工教育培训和年度考核，专业技术职务评聘的申报。

财务科: 负责机关财务管理，专项资金管理和监督，财务统计，固定资产管理工作。

政策法规科: 负责住房保障和房屋管理法律法规的贯彻执行与监督，起草地方规章，房地产执法监管，行政诉讼等事务。

住宅与房地产业科: 主管房地产市场，指导住房建设、危房改造，制定并监督实施相关规章制度，资质备案和房地产项目审批。

住房保障科 (住房制度改革委员会办公室): 制定住房改革政策，监督保障性住房建设，参与住房补贴审核和旗县住房保障指导工作。

住房公积金监管科: 制定公积金政策，监督资金管理，指导公积金管理工作，建设和管理公积金信息系统。

行政事项审批办公室: 执行国家行政审批政策，负责行政许可和非行政许可审批事项的办理，以及协调需上级机关审批的事项。