法律分析：运输合同印花税是合同的双方都是印花税的纳税人，双方都需要缴纳印花税，运输合同印花税=运费金额*万分之五。印花税不需要计提，实际缴纳运输合同印花税的时候账务处理是，借：税金及附加—印花税，贷：银行存款。

法律依据：《中华人民共和国印花税暂行条例》

第一条 在中华人民共和国境内书立、领受本条例所列举凭证的单位和个人，都是印花税的纳税义务人(以下简称纳税人)，应当按照本条例规定缴纳印花税。

第二条下列凭证为应纳税凭证：

(一)购销、加工承揽、建设工程承包、财产租赁、货物运输、仓储保管、借款、财产保险、技术合同或者具有合同性质的凭证(二)产权转移书据(三)营业帐簿(四)权利、许可证照(五)经财政部确定征税的其他凭证。