工程审计是一种专业的审计活动，其目的是通过独立行使审计权力，对工程建设项目的合规性、成本真实性和政策执行情况进行检查。审计过程中，要求审计人员保持客观公正，确保审计结果基于充分的事实和合理的判断。此外，审计工作还需关注工程管理中的不足，并提出具有针对性的改进建议，以提高投资效益。

工程审计程序包括以下几个主要步骤：

1. 审前准备：组建审计团队，并根据工程特点和审计需求进行专业搭配。发送结算审计通知书，明确需提交的资料和审计实施方案。制定审计计划，明确审计重点、任务分配和时间安排。

2. 审计阶段：审计人员在执行审计工作时，需坚持原则，对审计内容进行充分、准确的核实。重点关注工程竣工决算中的其他费用列支是否合理，并深入调查任何疑点。审计过程中，要求被审单位积极配合，确保资料及时提供。

3. 审计报告：审计完成后，整理分析审计资料，提出针对性的意见和操作性强的建议，并撰写审计报告。报告内容涵盖工程概况、审计情况、存在的问题及原因分析、防范措施等。

工程审计的主要内容包括：立项与执行情况审查、建设成本审核、 “五制”执行情况审查、交付使用资产审计以及投资效益评估。

为了确保审计质量，需采取以下措施：加强制度建设，规范内部管理；对审计发现的问题坚持“三不放过”原则；及时总结经验，提升审计规范化水平；加强对审计人员的业务培训，提高其专业水平和综合素质。

通过以上措施，工程审计在加强管理、控制投资、提高效益等方面发挥了重要作用，并取得了显著成效。