两者的区别是材质不同、功能不同、用途不同。

1、材质不同：羽绒棉并非真正的棉花，也不是纯羽绒，是一种由中空棉或丝绵制成的合成纤维。聚酯纤维，俗称涤纶，是由有机二元酸和二元醇缩聚而成的聚酯经纺丝制成的合成纤维。

2、功能不同：羽绒棉具有较强的保暖性，但不能耐高温。聚酯纤维则具有耐高温性能。

3、用途不同：羽绒棉常用于制作棉衣类服饰的内胆填充物，起到保暖隔温的作用，常常用来替代天然纤维（鸭绒和鹅绒）。聚酯纤维则常用于制作服饰面料。