法律分析：职工月工资扣除个人承担的三险一金和费用3500元，适用超额累进税率纳税。

法律依据：《中华人民共和国个人所得税法》

第二条 下列各项个人所得，应纳个人所得税：一、工资、薪金所得；第三条　个人所得税的税率：一、工资、薪金所得，适用超额累进税率，税率为百分之三至百分之四十五（税率表附后）、

第六条 应纳税所得额的计算：一、工资、薪金所得，以每月收入额减除费用三千五百元后的余额，为应纳税所得额。

《国务院个人所得税法实施条例》 第二十五条 按照国家规定，单位为个人缴付和个人缴付的基本养老保险费、基本医疗保险费、失业保险费、住房公积金，从纳税义务人的应纳税所得额中扣除。