一、消毒作用机理不同

1、次氯酸钠：次氯酸钠的消毒机理本质与氯相同，都是水解成次氯酸发挥作用。故也将其与次氯酸钙、氯胺、液氯消毒合并成为含氯消毒剂。

2、二氧化氯：二氧化氯在杀菌过程以氧化反应为主，不产生任何对人体有害物质。在使用中不但不会产生异味，而且会消除由于水中酚类及其它有机物产生的异味。

二、消毒效果不同

1、次氯酸钠：次氯酸钠在水质较差微生物含量较高或污染较严重的情况下，由于次氯酸钠杀菌速率较慢，杀菌效果也很差。

2、二氧化氯：二氧化氯由于氧化性强杀菌速度快，在水质差的情况下更凸显其杀菌的高效性能。

三、优势不同

二氧化氯作为第四代高效、广谱杀菌剂，杀菌过程为氧化还原反应，杀菌速率快，杀菌效果是次氯酸钠的4～5倍。二氧化氯与次氯酸钠相比具有较大的优势，可以达到对各种水处理杀菌、灭藻、除臭、去味的目的。

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