植物的根部需要进行呼吸作用，当被水淹时土壤缺氧，根部细胞进行无氧呼吸，产生乙醇。导致根部细胞死亡，进而植物根部腐烂。

一般情况下，树苗在水中的浸泡时间最好不要超过12小时，因为树苗的根系是需要呼吸的，如果在水中的浸泡时间过长，其根系就容易因为缺氧而死亡。

如果根死了幼苗就会失去吸收水分的器官而无法正常生长，但也有一些幼苗在种植前需要用水浸泡，比如树莓幼苗，这样才能使根部吸收足够的水分。

但有些幼苗在种植前需要用水浸泡。比如树莓幼苗的根部一定要在水中浸泡12-24小时，这样才能使根部吸收足够的水分。吸饱水的新苗木可以从根部发出，产量会比较高，一年生的树枝一般会在同一年结果实。