支付工程设计费应该计入固定资产入账成本。

如果是为自己单位建造房屋建筑物发生的工程设计费应计入到该设计的固定资产入账成本中：

借：在建工程，

借：应交税费-应交增值税-进项税额，

贷：其他应付款、银行存款。

在建工程达到预定可使用状态后，转为固定资产：

借：固定资产，

贷：在建工程。