在烧三周年纪念日，女儿可以通过以下方式缅怀父亲：

1. 献上鲜花：选取父亲生前喜爱的花卉，如菊花或玫瑰，以此表达对父亲的深切怀念和崇高敬意。

2. 准备美食：精心挑选父亲生前喜爱的水果和糕点，通过这些美食来缅怀他的味道和饮食习惯。

3. 赠送黄玉：黄玉作为一种具有特殊意义的祭奠物品，不仅能够寄托对逝者的思念，还具有辟邪的寓意。

4. 供奉桔子：桔子因其吉祥的寓意，常被用于纪念活动。它象征着好运和希望，是对父亲美好祝愿的体现。

综上所述，女儿在烧三周年纪念日应该选择合适的物品来缅怀父亲，同时也要考虑到当地的风俗习惯和对环境保护的责任。