香菜的种子有一个圆圆比较硬的外壳，如果不破开外壳，种子吸水速度很慢，需要的泡水时间更长，且发芽阻力很大。找来一块平面的木板之类工具，把香菜种子放在平面上，稍稍用力搓压种子，让外壳裂开。注意，不可使用小面积的工具大力搓压种子，防止把种子碾碎了，那样就彻底无法发芽啦。

把香菜种子破壳后，就可以浸种了。可以把香菜种子直接倒进容器里加清水浸泡，也可以用纱布把种子包起来，然后放到清水里浸泡。浸泡时间要在24小时以上48小时以内为宜，尽量不要超过48小时，绝对不要超过72小时。注意，浸泡种子的容器要经过消毒杀菌，容器和水都要干净无油污。

一些香菜种子可能会带病菌，尤其是烂叶烂根类病菌，那样对出苗率影响很大，因此，在浸种的时候，可以加一些消毒杀菌剂进去。一般农技种子站都会有种子杀菌剂卖的，买杀菌剂的时候要对师傅说明是什么种子。一般可用水稻浸种消毒杀菌的强氯精。

浸种时间足够后，就要把种子捞起来，或是把浸种的水滤去，然后用清水冲洗一遍种子,之后把种子捞起来稍稍沥干种子表面的水分，以便下一步催芽或是播种用。