在土地增值税清算中，成本如何归集扣除是关键因素，直接影响着增值额的确定，进而影响纳税人的税负水平。成本归集扣除主要分为直接归集扣除和分摊扣除两种方法。分摊扣除又包括了占地面积法、建筑面积法等多种方法。那么，这些方法与受益原则之间有何关系？在选择扣除方法时是否需要考虑受益原则？本文将梳理成本归集扣除的相关政策，并探讨受益原则在土地增值税清算中的应用，以此说明按受益原则选择成本归集扣除方法的必要性。

成本归集扣除方法的规定

国家层面的规定主要体现在《土地增值税清算管理规程》中，该规程要求合理归集成本费用，包括直接发生的成本和应当分摊的成本。对于应当分摊的成本，具体分摊方法在《土地增值税暂行条例实施细则》中有明确的规定，但并未给出详细的执行口径。地方层面的规定则根据《实施细则》的授权，制定了具体执行办法，有的地方明确将受益原则作为指导原则，而有的地方则直接规定了成本归集方法。

案例一展示了税企就成本归集方法发生争议并最终法院支持按固定方法归集的情形，案例二则展示了法院支持按受益原则归集成本的案例。这些案例说明了成本归集方法的具体适用争议，同时也表明了法院在处理此类争议时的考量，即是否符合受益原则。

成本归集方法的选择——以受益原则为根本遵循

成本归集方法的初衷在于准确核算增值额，实现税收公平。因此，受益原则在成本归集扣除中具有适用的必要性和优先性。在进行清算活动时，应遵循受益原则，合理分摊共同成本费用。在具体房地产项目清算时，应结合个案实际情况，选择最符合受益原则的成本归集方法，而非机械地适用固定方法。

然而，当前税务执法主流仍以适用地方具体规定为主。纳税人如需采用其他合理方法进行成本归集，应事先征询税务机关的意见，并积极阐述所用方法的合理性，以争取有利于纳税人的处理结果。忽视受益原则可能导致扣除项目被调整，增加税负风险。

总的来说，成本归集扣除在土地增值税清算中的应用需充分考虑受益原则，以实现税负的公平性和合理性。在实际操作中，应灵活运用政策规定，结合具体情况进行成本归集，以避免不必要的税务风险。