到发证机关进行注销。

可以去当地建筑渣土消纳管理办公室，如果没有此部门，也可以去市绿化和市容管理局下属市城乡建设和管理委员会或其他相关部门按以下流程办理。

法律依据：《城市建筑垃圾和工程渣土处理规定》第十四条工程渣土处置场地的经营管理单位在处置工程渣土前，应当到区市容环境卫生行政主管部门办理登记手续。

若备案申请是你个人去的，你自己就可以申请注销；若以公司名义申请备案，则需要公司配合注销备案。